RT Journal Article
T1 A Novel and Divergent Gyrovirus with Unusual Genomic Features Detected in Wild Passerine Birds from a Remote Rainforest in French Guiana
A1 Truchado Martín, Daniel Alejandro
A1 Díaz-Piqueras, José Manuel
A1 Gómez-Lucía Duato, María Esperanza
A1 Domenech Gómez, Ana María
A1 Milá, Borja
A1 Pérez Tris, Javier
A1 Schmidt-Chanasit, Jonas
A1 Cadar, Daniel
A1 Benítez Rico, Laura
AB Sequence-independent amplification techniques have become important tools for virus discovery, metagenomics, and exploration of viral diversity at the global scale, especially in remote areas. Here, we describe the detection and genetic characterization of a novel gyrovirus, named GyV11, present in cloacal, oral, and blood samples from neotropical wild birds in French Guiana. The molecular epidemiology revealed the presence of GyV11 only in passerine birds from three different species at a low prevalence (0.73%). This is the first characterization and prevalence study of a gyrovirus carried out in resident wild bird populations in a remote region, and provides evidence of the fecal–oral route transmission and local circulation of the virus. The molecular phylogeny of gyroviruses reveals the existence of two distinct gyrovirus lineages in which GyV11 is phylogenetically distinct from previously reported gyroviruses. Furthermore, GyV11 is placed basal in the gyrovirus phylogeny, likely owing to its ancestral origin and marked divergence. This study also provides important insights into the ecology, epidemiology, and genomic features of gyroviruses in a remote neotropical rainforest. The pathogenesis of this virus in avian species or whether GyV11 can infect humans and/or chickens needs to be further investigated.
AB En esta publicación se describe la detección mediante análisis metagenómico y la caracterización genómica de un nuevo gyrovirus (GyV11) en muestras cloacales, orales y de sangre de tres especies de paseriformes neotropicales muestreados en la Reserva Natural de Nouragues (Guayana Francesa). La prevalencia del nuevo gyrovirus es baja en la población estudiada (0,73%, n = 406 individuos). GyV11 es filogenéticamente distinto a los gyrovirus reportados previamente, situándose de forma basal en la filogenia de este grupo de virus posiblemente debido a su origen ancestral y marcada divergencia. Este estudio es el primero en caracterizar y analizar la prevalencia de un nuevo gyrovirus en una población de aves silvestres residentes de un área remota y muestra evidencias tanto de la transmisión fecal-oral del virus como de su circulación en la población analizada. Además, pone de manifiesto la importancia de la secuenciación profunda como herramienta para el descubrimiento de nuevos virus en zonas remotas.
PB MDPI
SN 1999-4915
YR 2019
FD 2019-12-11
LK https://hdl.handle.net/20.500.14352/6426
UL https://hdl.handle.net/20.500.14352/6426
LA eng
NO Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO)/FEDER
NO Center of the Study of Biodiversity in Amazonia (CEBA)
NO Agence Nationale de la Recherche (ANR)
NO Universidad Complutense de Madrid (UCM)
DS Docta Complutense
RD 15 abr 2025