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An optimized method for high-quality RNA extraction from distinctive intrinsic laryngeal muscles in the rat model Kemfack, Angela M Hernández-Morato, Ignacio Moayedi, Yalda Pitman, Michael J Músculos laríngeos Músculo esquelético Ratas Anatomía Genética Biología molecular (Biología) 2401.01 Anatomía Animal 2409 Genética 2302.21 Biología Molecular Los desafíos relacionados con la extracción de ARN de alta calidad a partir de tejido post mortem han limitado la aplicación de la secuenciación de ARN (RNA-seq) en ciertos grupos de músculos esqueléticos, incluidos los músculos laríngeos intrínsecos (ILM). El presente estudio identificó factores críticos que contribuyen a la extracción deficiente de ARN de los ILM y estableció un método adecuado que permitió un análisis de alto rendimiento. Aquí, se adaptaron las técnicas estándar para el procesamiento de tejidos y se determinó un medio eficaz para controlar los efectos de confusión durante la preparación de la muestra. El procedimiento experimental proporcionó de manera constante suficiente ARN total intacto (N = 68) y RIN que oscilaban entre 7,0 y 8,6, lo que no tenía precedentes utilizando protocolos estándar de purificación de ARN. Este estudio confirmó la reproducibilidad del flujo de trabajo a través de ensayos repetidos en diferentes puntos temporales posnatales y en los distintos ILM. Los diagnósticos de alto rendimiento de 90 muestras de ARN no indicaron puntuaciones de alineación de secuenciación por debajo del 70%, lo que validó la estrategia de extracción. Las diferencias significativas entre las condiciones estándar y experimentales sugieren desafíos evitados y una amplia aplicabilidad a otros músculos esqueléticos. Esta investigación continúa en curso dada la perspectiva de obtener conocimientos terapéuticos para trastornos de la voz, la deglución y las vías respiratorias. La metodología actual respalda investigaciones pioneras sobre el transcriptoma global en la laringe que anteriormente no tenían fundamento en la literatura. Depto. de Anatomía y Embriología Fac. de Medicina TRUE pub 2025-01-10T11:49:52Z 2025-01-10T11:49:52Z 2022 journal article VoR https://hdl.handle.net/20.500.14352/113699 XXXX-XXXX 10.1038/S41598-022-25643-Y eng Kemfack, A.M., Hernandez-Morato, I., Moayedi, Y. et al. An optimized method for high-quality RNA extraction from distinctive intrinsic laryngeal muscles in the rat model. Sci Rep 12, 21665 (2022). Attribution-NonCommercial 4.0 International http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ open access application/pdf application/pdf