Aviso: para depositar documentos, por favor, inicia sesión e identifícate con tu cuenta de correo institucional de la UCM con el botón MI CUENTA UCM. No emplees la opción AUTENTICACIÓN CON CONTRASEÑA
 

Estudio del problema del plegado de proteínas

dc.contributor.advisorRodríguez Laguna, Ismael
dc.contributor.advisorRubio Díez, Fernando
dc.contributor.authorJiménez Arenas, Javier
dc.date.accessioned2024-07-22T08:10:57Z
dc.date.available2024-07-22T08:10:57Z
dc.date.issued2024
dc.degree.titleDoble Grado en Ingeniería Informática y Matemáticas
dc.descriptionTrabajo de Fin de Grado del Doble Grado en Ingeniería Informática y Matemáticas, Facultad de Informática UCM, Departamento de Sistemas Informáticos y Computación, Curso 2023/2024. Información adicional del algoritmo en GitHub: https://github.com/Javi153/TFG/tree/main/Codigo/Algoritmo%20genetico%20HP https://github.com/Javi153/TFG/tree/main/Codigo/Algoritmo%20aproximacion%20HP https://github.com/Javi153/TFG/tree/main/Codigo/Algoritmo%20aproximacion%20HPNX
dc.description.abstractEn este trabajo se trata el problema del plegado de proteínas, uno de los problemas más importantes de la bioinformática. Esta disciplina estudia la aplicación de tecnologías informáticas, estadísticas y matemáticas para la resolución de problemas abiertos en biología. A lo largo del texto se estudiarán distintos modelos matemáticos propuestos en base a su complejidad y aproximabilidad. Se darán en primer lugar nociones básicas sobre estas ramas de las ciencias de la computación y las distintas clases en las que se pueden agrupar los problemas informáticos. Tras esto se explicarán las demos tracciones existentes para los modelos recogidos, sirviendo para aunar conocimiento diverso sobre la materia. Adicionalmente, se hablará de un nuevo modelo propuesto originalmente en este trabajo teniendo en cuenta las propiedades bioquímicas de las proteínas. El nuevo modelo está creado en colaboración con estudiantes de bioquímica que nos han asesorado para asegurar la corrección del mismo. La segunda parte del trabajo se centrará en poner a prueba los algoritmos pro puestos e implementados, comparando su eficiencia en cada caso para distintos modelos y en contraposición a otras formas de resolución de algoritmos de optimización como los algoritmos bioinspirados.
dc.description.abstractIn this work we cover the protein folding problem, one of the most important problems in bioinformatics. This discipline studies the application of computer tech nologies, statistics and mathematics to the resolution of open problems in biology. Throughout this text several mathematical models will be studied according to their complexity and approximability. Firstly, we will introduce some basic notions about these areas in computer science and the different classes in which we can group informatic problems. After this we will explain existing demonstrations for the treated problems in order to unite diverse knowledge about this matter. Addi tionally, we will propose an original new model taking the biochemical properties of proteins into account. This model is created in collaboration with biochemistry students who have helped us to assure its correction. The second part of the work will focus on testing the proposed and implemented algorithms to check their efficiency for different models and test them against other forms of resolution for optimization problems such as bioinspired algorithms.
dc.description.departmentDepto. de Sistemas Informáticos y Computación
dc.description.facultyFac. de Informática
dc.description.refereedTRUE
dc.description.statusunpub
dc.identifier.relatedurlhttps://github.com/Javi153/TFG/tree/main/Codigo/Algoritmo%20genetico%20HP
dc.identifier.relatedurlhttps://github.com/Javi153/TFG/tree/main/Codigo/Algoritmo%20aproximacion%20HP
dc.identifier.relatedurlhttps://github.com/Javi153/TFG/tree/main/Codigo/Algoritmo%20aproximacion%20HPNX
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.14352/106956
dc.language.isospa
dc.page.total88
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internationalen
dc.rights.accessRightsopen access
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject.cdu004(043.3)
dc.subject.keywordComplejidad
dc.subject.keywordAproximabilidad
dc.subject.keywordBioinformática
dc.subject.keywordProteína
dc.subject.keywordModelización
dc.subject.keywordAlgoritmo genético
dc.subject.keywordOptimización
dc.subject.keywordAminoácido
dc.subject.keywordComplexity
dc.subject.keywordApproximability
dc.subject.keywordBioinformatics
dc.subject.keywordProtein
dc.subject.keywordModelling
dc.subject.keywordGenetic Algorithm
dc.subject.keywordOptimization
dc.subject.keywordAminoacid
dc.subject.ucmInformática (Informática)
dc.subject.unesco33 Ciencias Tecnológicas
dc.titleEstudio del problema del plegado de proteínas
dc.title.alternativeAnalysis of the protein folding problem
dc.typebachelor thesis
dc.type.hasVersionAM
dspace.entity.typePublication
relation.isAdvisorOfPublication28429d40-53cb-4bb3-a3f6-82ec557a34ed
relation.isAdvisorOfPublication24d04c3b-f9e3-4ad0-95cb-c28e064f7a03
relation.isAdvisorOfPublication.latestForDiscovery28429d40-53cb-4bb3-a3f6-82ec557a34ed

Download

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Estudio_problema_plegado_proteínas_TFG.pdf
Size:
3.29 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Estudio del problema del plegado de proteínas