Computational studies of carbohydrate-protein interactions

Abstract

Molecular modelling techniques have been extensively applied to the elucidation of glycan-protein interactions at the atomic level of several systems with biological and therapeutic interests, and have provided new insights for the understanding of the molecular recognition events underlying the biological functions of these systems. In this Thesis, the general objective is to elucidate the carbohydrate-protein interactions at the atomic level through computational techniques. In particular, the following systems have been studied: human galectins -1, -3, and -7, Pisum sativum lectin, Maackia amurensis seed lectin, and glycosyltransferase GalNAc-T2. The final aim is to provide new insights for the understanding of the molecular recognition events underlying the biological functions of these proteins...En esta Tesis Doctoral, se han empleado técnicas de modelado molecular para la elucidación a nivel atómico de las interacciones carbohidrato-proteína de varios sistemas con interés biológico y terapéutico. Estos estudios han permitido aportar nuevas perspectivas para la comprensión de los procesos de reconocimiento molecular implicados en las funciones biológicas de estos sistemas. En particular, se han estudiado los siguientes sistemas: galectinas humanas -1, -3 y -7, lectina de Pisum sativum, lectina de semillas de Maackia amurensis, y la glicosiltransferasa GalNAc-T2. El objetivo final es proporcionar nuevas perspectivas para la comprensión de los eventos de reconocimiento molecular que subyacen en las funciones biológicas de estas proteínas...