Candida spp. colonization: a genotype source found in blood cultures that can become widespread

Abstract

Objetivo: El estudio analiza si los genotipos de Candida albicans, C. parapsilosis y C. tropicalis que colonizan distintas localizaciones anatómicas pueden encontrarse también en hemocultivos, y si estos genotipos coincidentes presentan mayor probabilidad de ser genotipos “generalizados” o widespread (aquellos detectados en pacientes no relacionados e incluso en distintos hospitales). Métodos: Se estudiaron 640 aislamientos de Candida pertenecientes a 323 pacientes (2016–2019). Las muestras procedían de hemocultivos, catéteres, tracto respiratorio inferior, piel/mucosas y orina. Todos los aislamientos se genotiparon mediante microsatélites. Los genotipos se clasificaron como: Singletons (únicos), Matches (mismo genotipo en distintas muestras de un mismo paciente), Clusters (mismo genotipo en ≥2 pacientes). Los genotipos se compararon con una base de datos propia que contenía 587 genotipos de sangre (2007–2023) para identificar genotipos presentes también en hemocultivos y aquellos previamente definidos como widespread. Resultados principales: 94 % de los pacientes con candidemia y colonización presentaron el mismo genotipo en sangre y en la localización colonizada. 31 % de los genotipos colonizantes se encontraron también en hemocultivos; la proporción fue mayor en C. parapsilosis (57,6%). Los catéteres fueron la fuente colonizante que más frecuentemente coincidió con hemocultivos (79,2 %). Se identificaron 21 clusters (6,1 %), implicando muestras de sangre y colonización de distintas localizaciones. Los genotipos detectados tanto en colonización como en sangre mostraron una probabilidad significativamente mayor de ser widespread (31,9%) en comparación con los exclusivos de sangre (7,1%) o los exclusivos de colonización (3,7%). Conclusiones: La mayoría de los pacientes con candidemia estaban colonizados por el mismo genotipo que causó la infección. Aproximadamente un tercio de los genotipos colonizantes pueden progresar a candidemia, especialmente los presentes en catéteres. Además, los genotipos compartidos entre colonización y sangre tienen mayor probabilidad de ser genotipos widespread, lo que sugiere su especial capacidad para causar enfermedad invasora.