Enfermedad inflamatoria crónica intestinal canina : estudio clínico y caracterización de la microbiota a partir de muestras de heces y biopsias duodenales

Abstract

La enfermedad inflamatoria crónica intestinal (EICI) es una enfermedad de base inmunomediada caracterizada por la persistencia y recurrencia de signos clínicos gastrointestinales, que constituye una de las causas más frecuentes de vómito y diarrea crónica en la especie canina. La patogenia de la EICI es multifactorial e implica la pérdida de tolerancia a la dieta y los componentes de la microbiota, causando una respuesta inmunitaria exacerbada. El diagnóstico de la enfermedad se alcanza tras realizar un protocolo de exclusión completo de todas las causas que puedan desencadenar un proceso inflamatorio a nivel intestinal y con la evidencia histológica de un infiltrado inflamatorio en la mucosa del intestino delgado, grueso o ambos.La estrecha relación entre el epitelio intestinal del hospedador, el sistema inmunitario y la microbiota, hace que cambios en el ecosistema intestinal que afecten a cualquiera de estos pilares, pueda implicar modificaciones en el resto. En esta línea, y considerando que la microbiota intestinal constituye una compleja población de microorganismos que tienen un papel determinante en el estado de salud del hospedador canino, se ha sugerido que las alteraciones en la microbiota intestinal pueden constituir un potencial biomarcador en la EICI canina. La mayoría de los estudios basados en técnicas de secuenciación realizados hasta la fecha en la especie canina se han centrado en el componente bacteriano de la microbiota fecal. Sin embargo, si la EICI afecta principalmente al intestino delgado, la microbiota asociada a la mucosa intestinal debería mostrar alteraciones más marcadas que la microbiota de muestras fecales. Las heces no proporcionan información completa sobre la potencial presencia de bacterias entero-invasivas o adheridas a la mucosa, ni sobre la composición de la microbiota del intestino delgado. Además, algunos trabajos recientes en medicina humana han mostrado que las alteraciones de la microbiota asociada a la mucosa intestinal presentan una mayor correlación con los índices clínicos de la enfermedad que aquellas observadas en las heces. Este hecho condujo al planteamiento de este trabajo de investigación, cuyo objetivo principal es la caracterización de la microbiota intestinal en la EICI canina, tanto en la mucosa duodenal como en las heces...Inflammatory bowel disease (IBD) is an immune-mediated disease characterized by the persistence and recurrence of gastrointestinal clinical signs, which constitutes the main cause of chronic vomiting and diarrhea in the canine species. The pathogenesis of IBD is multifactorial and involves loss of tolerance to diet and microbial components, causing an exacerbated immune response. The diagnosis is reached after carrying out an exclusion protocol of all the potential causes that may trigger intestinal inflammation and with histological evidence of an inflammatory infiltrate of the small, large intestine or both.Due to the close interaction between the intestinal epithelium, the immune system, and the microbiota, changes in the intestinal ecosystem that affect any of these pillars leads to changes in the rest. In this sense, the intestinal microbiota constitutes a complex population of microorganisms that plays a key role in the health status of the canine host. It has been suggested that the evaluation of gut microbiota may be used as a potential biomarker in canine IBD. Most studies based on sequencing techniques carried out to date in the canine species have focused on the bacterial component of the fecal microbiota. However, this type of sample does not provide complete information on the potential presence of entero-invasive or mucosa-adherent bacteria, nor on the composition of the microbiota of the small intestine. Moreover, as IBD mainly affects the small intestine, the microbiota associated with the intestinal mucosa should present more marked alterations than the microbiota of fecal samples. In this sense, some recent works in human medicine have shown a stronger correlation between the clinical indexes of the disease and the alterations in the intestinal mucosa-associated microbiota than those observed in feces. This fact led to the approach of this research, whose main objective is the characterization of the intestinal microbiota in canine IBD, both in the duodenal mucosa and in feces...