Estudio de la transmisión y la epidemiología de "Clostridiodes difficile" mediante la secuenciación genoma completo

Abstract

Clostridioides difficile es un bacilo grampositivo, anaerobio productor de esporas y uno de los patógenos nosocomiales más importantes. La infección causada por C. difficile (ICD) es la principal causa de diarrea asociada al consumo de antibióticos en todo el mundo, y su epidemiología ha cambiado tras la irrupción de los ribotipos hipervirulentos e hiperepidémicos 027 y 078 a principios de los años 2000. Estas cepas causan infecciones más graves, con mayor mortalidad, presentan mayor capacidad de transmisión y se han diseminado por todo el mundo. El conocimiento de la epidemiología de este microorganismo en nuestro entorno es limitado y es por ello que se planteó la realización de esta Tesis Doctoral, con el objetivo principal de estudiar la epidemiología de la ICD en el Hospital Universitario Ramón y Cajal de Madrid, mediante la puesta a punto de las técnicas de ribotipificación por PCR y la posterior electroforesis capilar así como la secuenciación de genomas completos (SGC)...

Clostridioides difficile is a grampositive, anaerobic, spore-forming bacillus and one of the most important nosocomial pathogens. C. difficile infection (CDI) is the leading cause of diarrhoea associated with antibiotic use worldwide. The epidemiology of the ICD has changed after the emergence of the hypervirulent and hyperepidemic ribotypes 027 and 078 in the early 2000s. These strains cause more severe infections, with higher mortality, higher transmissibility and worldwide dissemination. Data concerning the epidemiology of this microorganism in our environment are limited, and this is, mainly, the main reason of this Doctoral Thesis. Our principal objective was the study of the epidemiology of ICD at the Hospital Universitario Ramón y Cajal in Madrid, through the development of PCR ribotyping techniques and the subsequent capillary electrophoresis as well as the sequencing of complete genomes (SGC)...