Propiedades dinámicas y termodinámicas de líquidos compuestos por moléculas lineales y complejas a partir de métodos mecanoestadísticos

Abstract

El comportamiento de una gran diversidad de fluidos se ha estudiado mediante simulación por ordenador. En primer lugar, se ha analizado el efecto causado por la presencia de cargas puntuales en fluidos constituidos por moléculas lineales y pseudolineales y las variaciones que ocasionan estas cargas sobre sus propiedades dinámicas y termodinámicas. Continuando con sistemas lineales, y aplicando la técnica de Dinámica Molecular se ha estudiado la transferencia de energía resonante, la espectroscopía molecular de estos sistemas y las relaciones de Hubbard, que pueden deducirse a partir de las teorías estocásticas de perturbación de primer orden. Además, se han llevado a cabo simulaciones por el método de Monte Carlo en el colectivo canónico para obtener propiedades termodinámicas de sistemas no lineales constituidos por moléculas angulares. Por último, se han realizado simulaciones de biomoléculas constituidas por un gran número de aminoácidos recurriendo al GROMOS96,un paquete de programas de simulación y analisis para sistemas constituidos pro péptidos y/o proteínas. El objetivo de éstas simulaciones ha sido el analizar las variaciones que experimenta, a lo largo de diez nanosegundos, el dominio NH3 de la proteína de ratón mGrb2 en tres condiciones distintas: en medio acuoso, en presencia del péptido mSos2-A y, por último , en una disolución 50 mM de sulfato de sodio