Dynamics of genomic diversity and viability of endangered livestock populations : the example of the Gochu Asturcelta pig breed

Abstract

This PhD Thesis aims at the assessment of the patterns and drivers of genetic variation in smalllive stock populations, focusing on the relationship between inbreeding, genetic diversity, and the evolutionary potential of endangered populations. Local livestock populations, such as the endangered Gochu Asturcelta pig, native to Asturias, Northwestern Spain, are particularly vulnerable to genetic bottlenecks and inbreeding, making the preservation of their genetic diversity challenging. While the increasing availability of molecular data could allow the computation of several diversity parameters, the particular pedigree of the Gochu Asturcelta pigbreed, characterized by a low number of founders and large families, offers an opportunity to evaluate their usefulness...Esta Tesis doctoral evalúa los patrones y factores que contribuyen a la variación genética en poblaciones ganaderas pequeñas, con especial atención a la relación entre la consanguinidad, la diversidad genética y el potencial evolutivo de poblaciones ganaderas en peligro de extinción. Las poblaciones locales de ganado, como el cerdo Gochu Asturcelta, originario de Asturias (España), son vulnerables ante cuellos de botella genéticos y el efecto de la consanguinidad, lo que afecta a su diversidad genética y complica su preservación. Aunque la disponibilidad de información molecular permite calcular diferentes parámetros de diversidad, su utilidad todavía debe ser correctamente evaluada. El pedigrí del Gochu Asturcelta, con pocos fundadores y familias numerosas, ofrece una oportunidad para evaluar su aplicación en pequeñas poblaciones ganaderas...