5-gene differential expression predicts stability of human intestinal allografts

Abstract

En los aloinjertos intestinales, la endoscopia y la histología detectan la lesión una vez que se han producido cambios en la arquitectura de la pared intestinal. Nuestro objetivo fue identificar una firma molecular que pudiera predecir el deterioro temprano, dentro de biopsias histológicamente indistinguibles con patología de "cambios mínimos" (CM). Se tomaron longitudinalmente sesenta biopsias de 12 receptores adultos durante 8 años posteriores al trasplante. Se clasificaron como estables (STA) o no estables (NSTA) según el número, la frecuencia y la gravedad de los eventos de rechazo del aloinjerto registrados prospectivamente. En un conjunto de descubrimiento de muestras de CM analizadas por RNA-Seq, 816 genes se expresaron de manera diferencial en biopsias STA vs NSTA. Un grupo de 5 genes (ADH1C, SLC39A4, CYP4F2, OPTN y PDZK1) clasificó correctamente todas las biopsias NSTA en el conjunto de descubrimiento y todas las biopsias STA de un conjunto independiente. Estos resultados se validaron por qPCR en un nuevo grupo de biopsias de CM. Con base en un modelo de regresión logística, un punto de corte de 0,28 predijo la probabilidad de ser una biopsia NSTA con una sensibilidad del 85% y una especificidad del 69%. En conclusión, al analizar muestras de MC de manera temprana después del trasplante, la expresión de un conjunto de 5 genes puede predecir la evolución del aloinjerto intestinal. Este biomarcador pronóstico puede ser de ayuda para personalizar la atención del receptor de trasplante intestinal.