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BIOSEQ: una librería para bioinformática en R

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dc.contributor.advisorLópez López, María Victoria
dc.contributor.advisorGonzález Pérez, Beatriz
dc.contributor.authorMartínez Ladrón de Guevara, Jorge
dc.date.accessioned2023-06-19T16:07:37Z
dc.date.available2023-06-19T16:07:37Z
dc.date.issued2013
dc.descriptionTrabajo de Fin de Máster en Ingeniería de Computadores
dc.description.abstractEste trabajo desarrolla temas de programación avanzada en R, como la programación orientada a objetos o el desarrollo de librerías externas C para el diseño y desarrollo de paquetes R. Además, describe la estructura de carpetas y archivos de un paquete R y el proceso de verificación y compilación necesario para su distribución. Por último, describe las funciones Smith-Waterman y Needleman-Wunsch para alineamiento de secuencias, incluidas en la librería BioSeq. [ABSTRACT] This document focuses on advanced topics in R programming useful for package development, covering Object Oriented Programming and the interface with C libraries. This work also describes the structure of an R packages and its contents, and the compilation process necessary for distribution. Finally, it describes Smith-Waterman and Needleman-Wunsch functions for sequence alignment which are included in BioSeq package
dc.description.departmentDepto. de Arquitectura de Computadores y Automática
dc.description.facultyFac. de Informática
dc.description.refereedTRUE
dc.description.statusunpub
dc.eprint.idhttps://eprints.ucm.es/id/eprint/22633
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.14352/36310
dc.language.isospa
dc.page.total128
dc.rightsAtribución-NoComercial 3.0 España
dc.rights.accessRightsopen access
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/es/
dc.subject.cdu004.438R(043.3)
dc.subject.cdu57:004(043.3)
dc.subject.cdu004:57(043.3)
dc.subject.cdu57.087.1(043.3)
dc.subject.keywordProgramación en R
dc.subject.keywordClases S3
dc.subject.keywordClases S4
dc.subject.keywordLibrerías externas C para R
dc.subject.keywordDesarrollo de paquetes en R
dc.subject.keywordAnálisis de secuencias
dc.subject.keywordSmith-Waterman
dc.subject.keywordNeedleman-Wunsch
dc.subject.keywordBioinformática
dc.subject.keywordR programming language
dc.subject.keywordS3 classes
dc.subject.keywordS4 classes
dc.subject.keywordC external libraries for R
dc.subject.keywordPackage development in R
dc.subject.keywordSequence analysis
dc.subject.keywordBioinformatics
dc.subject.ucmLenguajes de programación
dc.subject.unesco1203.23 Lenguajes de Programación
dc.titleBIOSEQ: una librería para bioinformática en R
dc.typemaster thesis
dspace.entity.typePublication
relation.isAdvisorOfPublicationf806566f-1e28-4933-b145-c9531c1ded1c
relation.isAdvisorOfPublication10d9023b-cb9d-4ef7-bde2-9478081ca100
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