Herramientas para el estudio de la microbiota y aplicaciones terapéuticas basadas en su modulación

Abstract

La última década ha supuesto una auténtica revolución en la caracterización de las comunidades microbianas que colonizan nuestro organismo, explorando su posible implicación en numerosas patologías y diseñando estrategias para su modulación. A pesar de la ingente cantidad de estudios publicados sobre microbiota humana, la heterogeneidad metodológica, el reto que supone el análisis de ecosistemas complejos y la ausencia de acuerdo para definir una microbiota normal han dificultado el alcance de conclusiones sólidas para muchas de las preguntas planteadas. Esta Tesis Doctoral tiene como objetivo principal estudiar la microbiota en distintos procesos fisiológicos y patológicos desde un punto de vista tanto composicional como funcional, empleando distintas tecnologías ómicas e incorporando técnicas basadas en el aprendizaje automático. Además, en el último capítulo se expone un método de optimización de la modulación de la microbiota mediante un abordaje basado en el estudio de la compatibilidad donante-receptor...

The last decade has been a true revolution in the characterization of the microbial communities that colonize our organism, exploring their possible involvement in numerous pathologies and designing strategies for their modulation. Despite the huge number of studies published on human microbiota, the methodological heterogeneity, the challenge of analyzing complex ecosystems and the lack of agreement on the definition of a normal microbiota have made it difficult to reach solid conclusions. The main objective of this PhD Thesis is to study the microbiota in different physiological and pathological processes from a compositional and functional point of view, using different omics technologies and incorporating analytical techniques based on machine-learning. In addition, the last chapter presents a method for optimizing microbiota modulation using an approach based on the study of donor-recipient immunological compatibility...